高中生侦探工藤新一被神秘组织毒害后，化名江户川柯南，寄居在青梅竹马毛利兰家中。他借助阿笠博士的发明，以孩童之身破解无数案件，同时秘密追查黑衣组织。每个案件背后都隐藏着人性挣扎与正义抉择，从密室杀人到连环阴谋，柯南用智慧揭露真相，守护身边的人。故事不仅展现推理的乐趣，更探讨了成长、勇气与牺牲的意义。